HPA是什么数据库

这篇文章主要介绍了HPA是什么数据库，具有一定借鉴价值，感兴趣的朋友可以参考下，希望大家阅读完这篇文章之后大有收获，下面让小编带着大家一起了解一下。

让客户满意是我们工作的目标，不断超越客户的期望值来自于我们对这个行业的热爱。我们立志把好的技术通过有效、简单的方式提供给客户，将通过不懈努力成为客户在信息化领域值得信任、有价值的长期合作伙伴，公司提供的服务项目有：域名申请、网络空间、营销软件、网站建设、怀远网站维护、网站推广。

HPA全称是Human Protein Atls，利用转录组学和蛋白质组学技术，从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达情况，网址如下

https://www.proteinatlas.org/

根据32个不同组织中蛋白编码基因的RNA_seq数据，将基因进行了分类，结果如下所示

HPA是什么数据库

鉴于分泌蛋白，膜相关蛋白在病理生理学中的重要作用，将蛋白划分了下图所示的不同类别进行研究

HPA是什么数据库

通过不同组织中的RNA_seq数据，分析了蛋白编码基因在不同组织中的富集情况，如下所示

HPA是什么数据库

可以看到在脑组织中，膜香瓜蛋白较多，而在肺中，分泌蛋白较多。除了对不同组织/细胞中的蛋白表达进行比较分析，还进一步研究了不同肿瘤中蛋白的表达情况。

在HPA中，又进一步划分成了以下3个子类

HPA是什么数据库

用于查看和分析蛋白编码基因在不同组织和器官中的表达情况，以MYL7为例，链接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000106631-MYL7/tissue
结果示意如下

HPA是什么数据库

提供了蛋白编码基因在不同细胞系中的表达情况，同时还体用了对应的亚细胞定位信息，以CCNB1为例，链接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000134057-CCNB1/cell

结果示意如下

HPA是什么数据库

提供了基因在肿瘤组织中的表达情况，以及生存分析，病理学图像等结果，以MK167为例，链接如下

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000148773-MKI67/pathology

结果示意如下

HPA是什么数据库

通过HPA数据库，可以方便的探究蛋白编码基因在正常和肿瘤组织/器官中的表达情况。

感谢你能够认真阅读完这篇文章，希望小编分享的“HPA是什么数据库”这篇文章对大家有帮助，同时也希望大家多多支持创新互联，关注创新互联行业资讯频道，更多相关知识等着你来学习!

网页名称：HPA是什么数据库
转载来源：http://mswzjz.cn/article/jcppjp.html

网站建设知识